在教练生涯中，阿根廷在四分之一决赛中被德国4-0击败。马拉多纳在世界杯后也辞去了阿根廷教练的职务。
然后，他在2011-12赛季执教阿联酋职业联赛的迪拜俱乐部Al Wasl。 2017年，马拉多纳成为富查伊拉的教练，然后在赛季结束前离开。 2018年5月，马拉多纳被宣布为白俄罗斯俱乐部迪纳摩·布列斯特（Dynamo Brest）的新董事长。他到达了布雷斯特，并由俱乐部邀请他于7月开始工作。从2018年9月到2019年6月，马拉多纳担任墨西哥俱乐部Dorados的教练。从2019年到去世，他一直是阿根廷Primera Division俱乐部Gimnasia de La Plata的教练。
2020年11月2日，马拉多纳因心理原因被送往拉普拉塔的一家医院。一天后，他接受了紧急脑部手术以治疗硬膜下血肿。手术成功后，他于11月12日获释，并在医生的监督下作为门诊病人。 2020年11月25日，年仅60岁的马拉多纳因心脏病发作在阿根廷布宜诺斯艾利斯蒂格雷的家中去世。